Jason Bourne, de voormalige CIA-agent met geheugenverlies wordt gezocht door de nieuwe held genaamd Aaron Cross die dankzij de pilletjes van het geheime The Program in staat is tot grootse acties.
John Smith (15) is een van negen vluchtelingen van de planeet Lorie͏̈n, die op aarde een schuilplaats hebben gevonden. Buitenaardse wezens proberen hen een voor een te doden. John is nummer vier op hun lijst