Leonardo da Vinci werkt aan Het Laatste Avondmaal, maar een moord en gestolen Byzantijnse teksten leiden tot een zoektocht door heel Italie͏̈. Mysterieuze aanwijzingen en symbolen helpen Leonardo en zijn vriend Pacioli.
Door haar onderzoek naar het leven van Maria Magdalena komt een Amerikaanse historica en journaliste in aanraking met de Orde, een door de katholieke kerk als ketters beschouwde leer.
De jonge, vrijgevochten Luciana werkt als prostituee en als schildersmodel. Een van haar voornaamste klanten vraagt haar om te poseren voor een bevriende schilder, Sandro Botticelli. Luciana poseert als de centrale figuur Flora op zijn beroemde schilderij La Primavera. Wanneer de kunstenaar haar wegstuurt zonder haar te betalen, steelt Luciana een niet afgemaakte miniatuur van het schilderij. Binnen een paar uur nadat ze de miniatuur onder haar rok had meegesmokkeld worden drie moorden gepleegd.
De liefde tussen de Italiaanse schilder Bernardo Luini (1480-1532) en de jonge weduwe Simonetta di Saronno lijkt onmogelijk; hij uit zijn gevoelens in zijn kunst, zij in het creëren van een amandellikeur.