In 1888 reizen een Britse tolk en een mysterieuze klokkenmaker, die verschillende missies hebben, samen naar Japan waar als de klokkenmaker vermist wordt de tolk hem gaat zoeken.
Een jongen in 19e-eeuws Japan, wees geworden door een hongersnood, wordt gered door een sekte van bergmonniken, bij wie hij zijn lichaam en geest op de proef moet stellen.
In het 19e-eeuwse Japan wordt een jonge vrouw uitgekozen om met de shogun te trouwen, met de bedoeling hem te bei͏̈nvloeden om de juiste beslissingen te nemen bij het tegenhouden van westerse indringers.
Eind 19e eeuw wordt een meisje ingewijd in de strenge hofregels in het paleis van de shogun en wordt diens officie͏̈le concubine, totdat er oorlog uitbreekt.
Japan, 1868. Hana is nog maar zeventien wanneer haar echtgenoot het leger in gaat en zij alleen achterblijft. Al snel wordt haar huis geplunderd door vijandige soldaten en moet ze vluchten voor haar leven. Ze vindt uiteindelijk onderdak in de Yoshiwara, de Stad Zonder Nacht. In die beruchte rosse buurt van Tokyo, waar drieduizend courtisanes leven, moet ook zij haar lichaam te koop aanbieden om het hoofd boven water te kunnen houden. Daar ontmoet ze Yozo, een avonturier en briljant zwaardvechter die zich als ontsnapt krijgsgevangene schuilhoudt voor de autoriteiten. Nergens kan dat beter dan in de Yoshiwara.
Rond 1870 wordt een 13-jarig Japans meisje verliefd op een iets oudere jongen uit het noordelijke deel van het land dat net is verslagen door de zuidelijke clan waartoe haar familie behoort.
Historisch overzicht van de culturele en politieke ontwikkelingen in Japan sedert de doorbreking van het isolement van dat land door de Amerikanen in 1853.