Wanneer een sheriff de moord op de dochter van een plaatselijke machthebber moet oplossen, lijkt dit eenvoudig omdat alles en iedereen in het modeldorpje met camera's wordt bespioneerd.
Geheim agent Ethan Burke doet in het bizarre bergdorp Wayward Pines onderzoek naar de vermissing van twee collega's. Hij stuit op onverklaarbare gebeurtenissen.