Twee Amsterdamse reclamejongens met een klein, maar prestigieus kantoor worden in 1998 door een vriend benaderd met een lumineus idee: merchandise ontwerpen en verkopen voor de naderende Gay Games.
1672. Nadat de festiviteiten vanwege het huwelijk van Marguerite van Valois, de zus van de Franse koning, met de hugenoot Henri van Navarre in een bloedbad eindigen, vlucht Minou Joubert met haar man Piet Reydon en hun kinderen naar Amsterdam.
Wie was Spinoza? Wie was deze moedige zeventiende-eeuwse figuur, deze geniale filosoof die met zijn geschriften de wereld veranderde, maar op zijn 25ste in de ban werd gedaan door de hele joodse gemeenschap van Amsterdam, inclusief zijn eigen familie? En wat was twee eeuwen later precies de fascinatie van de nazi's met Spinoza?
Na haar huwelijk met Johannes Brandt, VOC-koopman in het 17de eeuwse Amsterdam, moet Nella erg wennen aan haar nieuwe leven in het huis aan de Herengracht. Ze maakt kennis met Maren, Otto en Cornelia, die in haar plaats de scepter proberen te zwaaien. Als Johannes haar een poppenhuis cadeau geeft - een miniatuurversie van hun eigen huis - is Nella verrukt. Maar dan verschijnen er raadselachtige pakketjes met onderdelen voor het poppenhuis, die stuk voor stuk symbool staan voor intieme details uit het persoonlijk leven van de bewoners.
Een jonge joodse Amsterdammer, die door zijn donkere uiterlijk op een Marokkaan lijkt, gaat om zich af te zetten tegen zijn Amsterdamse kakkineuze milieu en uit nieuwsgierigheid op zoek naar zwarte vrouwen, eerst in de Bijlmer en later in Amerika.
Rembrandt van Rijn vereeuwigde in 1632 een les in anatomie op het schilderij 'De anatomische les van Dr. Nicolaes Tulp', maar diverse betrokkenen hebben toch wat moeite met de gang van zaken.
Rachel groeit op in een gezin dat erg heeft geleden onder tijdens de Tweede Wereldoorlog en haar familiegeschiedenis bepaalt nog altijd wie zij is en wat zij doet.
Voor het Tropenmuseum in Amsterdam ontploft in tram negen een bom, waarbij zeventien doden vallen. Bij de aanslag wordt ook een busje van de post vernield. Tussen de beschadigde poststukken worden dvd's gevonden met daarop snuffmovies die, zo blijkt later, in Brazilië gemaakt zijn. In Brazilië wordt inspecteur Mario Silva op de verdwijning van de kleindochter van een vooraanstaande en welvarende politicus gezet. Zowel deze zaak als de zaak van de snuffmovies leiden naar een stad die bol staat van corrupte politieagenten, armoede en criminaliteit.
