In het begin van de Tweede Wereldoorlog tracht de Engelse regering haar goudreserves uit Zuid-Afrika over zee naar eigen land te vervoeren wat de Duitsers proberen te verhinderen
Wanneer bekend wordt dat een onbekende hooggeplaatste figuur naar de Sovjet-Unie zal gaan overlopen, zetten de Westerse geheime diensten een speurtocht naar diens identiteit in.
Een Britse geheim agent verdwijnt spoorloos; terwijl iedereen hem zoekt schrijft hij de geschiedenis van zijn jeugd en zijn latere dubbelleven, vooral om zijn zoon alles uit te leggen.
Wanneer Jason Bourne in Zweden een man die aan geheugenverlies lijdt, redt uit het ijskoude water, beseft hij dat deze een huurmoordenaar voor een conglomeraat van terroristen is.
Een half-Poolse CIA-agent krijgt de opdracht in Krakow contact op te nemen met een informante in verband met de melding van een dubbele moord in Moskou.
Rechercheur John Corey en zijn vrouw FBI-agent Kate Mayfield, beiden lid van de federale Anti-Terrorist Task Force, krijgen te maken met een terroristisch complot, codenaam Vuurstorm, van Amerikaans extreem rechts waarbij nucleaire aanslagen gepleegd zullen worden op Los Angeles en San Francisco.