Het doolhof was slechts het begin voor Thomas, Minho, Teresa en Newt. Ze zijn nu ontsnapt uit het doolhof en gaan op zoek naar aanwijzingen over het mysterieuze plan van WCKD. De zoektocht brengt ze naar de Scorch, een verlaten stuk land met ondenkbare gevaren. De Gladers blijken niet de enigen te zijn die vechten tegen WCKD. Samen met een nieuwe groep, het verzet, proberen ze WCKD uit te schakelen.
